Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms