Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdhd1P59328 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdhd1P59328 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms