Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms