Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF1P22415 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USF1P22415 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF1P22415 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF1P22415 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
USF1P22415 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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