Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MsmbO08540 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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MsmbO08540 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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MsmbO08540 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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MsmbO08540 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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MsmbO08540 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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