Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms