Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.5 ms