Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms