Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms