Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms