Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab20P35295 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab20P35295 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab20P35295 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab20P35295 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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