Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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