Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc1E9Q043 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms