Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms