Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PtprdQ64487 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtprdQ64487 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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