Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC3Q15034 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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