Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dpf3P58269 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dpf3P58269 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dpf3P58269 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Dpf3P58269 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Dpf3P58269 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Dpf3P58269 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dpf3P58269 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dpf3P58269 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms