Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Defb1P56386 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms