Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrprbP47758 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms