Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms