Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSLP07711 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSLP07711 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSLP07711 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms