Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Opn1mwO35599 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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