Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn20G5E8X0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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