Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms