Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms