Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip4Q8CI96 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms