Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms