Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc10P31257 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms