Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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