Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518aB2RRF6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms