Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syt6Q9R0N8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms