Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irx6Q9ER75 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Irx6Q9ER75 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx6Q9ER75 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms