Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms