Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf628Q8CJ78 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf628Q8CJ78 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf628Q8CJ78 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Znf628Q8CJ78 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf628Q8CJ78 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf628Q8CJ78 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf628Q8CJ78 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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