Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp44Q8C2S0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp44Q8C2S0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp44Q8C2S0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp44Q8C2S0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp44Q8C2S0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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