Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms