Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms