Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

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Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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