Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja5Q01231 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms