Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PgrQ00175 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms