Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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