Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F6O75461 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F6O75461 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms