Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms