Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms