Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc33Q3ULW6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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