Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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NCOA1Q15788 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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NCOA1Q15788 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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NCOA1Q15788 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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NCOA1Q15788 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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NCOA1Q15788 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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NCOA1Q15788 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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