Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa7P02830 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa7P02830 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms