Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms