Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfn4Q9D6I3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfn4Q9D6I3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms