Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms